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桌面客户端

我们基于 Electron (opens new window) 构建了 Hiplot 的桌面客户端。示例数据和 UI 组件将在特定版本下被固定。

最新版本:

## Error in file(path): invalid 'description' argument

其他桌面版本: 这里 (opens new window)

hctl

hctl 是 Hiplot 网站的命令行程序. 它可以让用户在命令行环境下使用 Hiplot 网站的绘图系统。

最新发布版本 (v0.1.7):

## Error in file(path): invalid 'description' argument

其他 hctl 版本: 这里 (opens new window)

使用 hctl 进行绘图之前，用户需要使用 hctl login 命令获得 Hiplot 的服务授权。 登录成功后，即可使用 hctl plot 命令进行绘图：输入数据为一个 JSON 格式的参数文件和/或一个/多个数据表。

示例输入 demo.tar.gz (opens new window)。

## Linux 64 Demo
mkdir /tmp/hiplot
cd /tmp/hiplot
wget https://hiplot.cn/download/hctl/v0.1.7/hctl_0.1.7_Linux_64-bit.tar.gz
wget https://hiplot.cn/download/hctl/_demo.tar.gz

tar -xzvf hctl_0.1.7_Linux_64-bit.tar.gz
tar -xzvf _demo.tar.gz

./hctl login

# 只输入本地数据文件
./hctl plot -c _demo/heatmap/config.json -t heatmap -d _demo/heatmap/countData.txt,_demo/heatmap/sampleInfo.txt,_demo/heatmap/geneInfo.txt -o /tmp/hiplot-pure-data-mode

# 只使用远程服务器文件
./hctl plot -c _demo/heatmap/config2.json -t heatmap -o /tmp/hiplot-pure-remote-data-mode

# 混合使用本地数据和远程服务器文件
./hctl plot -c _demo/heatmap/config3.json -t heatmap -d _demo/heatmap/countData.txt,,_demo/heatmap/geneInfo.txt -o /tmp/hiplot-mixed-mode

# 使用 Hiplot 网站导出的参数文件
./hctl plot -p _demo/heatmap/params.json -t heatmap -o /tmp/hiplot-params-mode

# hiplot config 和 plot 命令联合
## 展示 hctl 支持的网页插件
hctl config -l
## 下载 basic/tsne 插件配置文件
hctl config basic/tsne
## 绘制 tsne 图形
hctl plot -p basic-tsne-params.json -o /tmp/hiplot-tsne

命令行主程序

## Command-line client to draw plots of [Hiplot](https://hiplot.cn) website. More see here https://github.com/hiplot.
## 
## Usage:
##   hctl [flags]
##   hctl [command]
## 
## Available Commands:
##   completion  Generate the autocompletion script for the specified shell
##   config      Initializing a config.json file of hiplot application.
##   help        Help about any command
##   login       Login Hiplot Website.
##   plot        Plot functions of Hiplot Website.
## 
## Flags:
##   -h, --help              help for hctl
##       --log-dir string    log dir. (default "/tmp/_log")
##   -o, --out-dir string    output dir. (default "/tmp")
##       --proxy string      HTTP proxy to query.
##       --save-log          Save log to file.
##   -k, --taskname string   task ID (default is random). (default "de58c778-e728-4c3d-a0e1-08506539563b")
##       --timeout int       set the timeout of per request. (default 35)
##       --verbose int       verbose level (0:no output, 1: basic level, 2: with env info) (default 1)
##   -v, --version           version for hctl
## 
## Use "hctl [command] --help" for more information about a command.

绘图子程序

## Plot functions of Hiplot Website.
## 
## Usage:
##   hctl plot [flags]
## 
## Examples:
##   hctl plot -c _demo/heatmap/config.json -t heatmap -d _demo/heatmap/countData.txt,_demo/heatmap/sampleInfo.txt,_demo/heatmap/geneInfo.txt -o /tmp/hiplot-pure-data-mode
##   hctl plot -c _demo/heatmap/config2.json -t heatmap -o /tmp/hiplot-pure-remote-data-mode
##   hctl plot -c _demo/heatmap/config3.json -t heatmap -d _demo/heatmap/countData.txt,,_demo/heatmap/geneInfo.txt -o /tmp/hiplot-mixed-mode
##   hctl plot -p _demo/heatmap/params.json -t heatmap -o /tmp/hiplot-params-mode
##   hctl plot -p _demo/heatmap/params2.json -o /tmp/hiplot-params-mode2
##   hctl plot -p _demo/heatmap/basic-heatmap-params.json --load-example true -o /tmp/hiplot-params-mode3
##   hctl plot --check-task --temp-code QwbMBp7 --taskname 62919a54-ee68-49c4-b070-7384c60fb05f --tool clusterprofiler-go-kegg -m advance -o /tmp/clusterprofiler-go-kegg
##   hctl config basic/pca
##   hctl plot -p basic-pca-params.json --load-example true -o /tmp/pca1
##   hctl plot -p basic-pca-params.json --load-example 2 -o /tmp/pca2
##   hctl plot -p _demo/tsne/basic-tsne-params.json -o /tmp/hiplot-tsne --load-example true
## 
## Flags:
##       --check-task            check task status, taskname and tmpcode are required.
##   -c, --config string         json format tool config file.
##   -d, --data string           data table file (sepreate by comma).
##   -h, --help                  help for plot
##       --load-example string   load example field (only work for hctl config export) (default "false")
##   -m, --module string         module name: basic, advance. (default "basic")
##   -p, --params string         json format tool params file (exported by Hiplot).
##       --print-links           print result links
##       --temp-code string      task tempcode. (default "KefaCzm")
##   -t, --tool string           tool name (e.g. heatmap).
## 
## Global Flags:
##       --log-dir string    log dir. (default "/tmp/_log")
##   -o, --out-dir string    output dir. (default "/tmp")
##       --proxy string      HTTP proxy to query.
##       --save-log          Save log to file.
##   -k, --taskname string   task ID (default is random). (default "9c88801a-da89-4c58-883e-8c861060365a")
##       --timeout int       set the timeout of per request. (default 35)
##       --verbose int       verbose level (0:no output, 1: basic level, 2: with env info) (default 1)