临床工具箱

AML-G1-G8

• 简介

  预测 AML 基因表达亚型。

  G1: PML::RARA

  G2: CBFB::MYH11

  G3: RUNX1::RUNXT1

  G4: biCEBPA/-like

  G5: myelodysplasia-related/-like

  G6: HOX-committed

  G7: HOX-primitive

  G8: HOX-mixed## AML-G1-G6

• 简介

  集成模型用于预测 AML 基因表达亚型。

  G1: PML-RARA

  G2: CBFB-MYH11

  G3: RUNX1-RUNXT1

  G4: Bialleic CEBPA

  G5: ...

  G6: NPM1/KMT2A/NUP98...

• 额外参数

  数据标准化方法：deseq2 vst 或 log2 (tpm + 1)

  模型：xgboost 或 autogluon

• 其他说明

  模型训练数据的基因名基于 hg38 GENCODE v34 基因注释文件

  'label' 行只用于检查最终结果的准确度，输入程序后会自动删除